Projekty

Medzinárodné

EpiLipidNET – Paneurópska sieť pre lipidomiku a epilipidomiku
Pan-European Network in Lipidomics and Epilipidomics
Program:	COST
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Balážová Mária, PhD.
Web stránka projektu:	https://www.cost.eu/actions/CA19105/#tabs|Name:overview
Doba trvania:	13.10.2020 – 12.10.2024

Aplikácia tymolu ako kŕmneho aditiva vo výžive králikov.
Application of thymol as feed additive in rabbit nutrition.
Program:	Mobility
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Plachá Iveta, PhD
Anotácia:	Fytogénne kŕmne aditiva sú schopné pozitívne ovplyvňovať využitelnosť a absorpciu živín a redukciu patogénnych mikroorganizmov v tráviacom trakte. Ich pozitívne účinky sa pripisujú najmä ich bioaktívnym molekulám (karvakrol, tymol, cineol, linalool). Za silné antioxidačné vlastnosti tymolu je zodpovedná hlavne jeho fenolická OH skupina. Jeho antimikrobialne účinky už boli popísané v mnohých štúdiach a jeho benefitom vo výžive zvierat je zamedzenie vzniku antibiotickej rezistencie na farmách. Hlavným problémom pri aplikácii rastlinných zložiek je ich zlá dostupnosť v cieľových orgánoch a tkanivách s čím úzko súvisí ich nedostatečný efekt. Z tohto dôvodu je naša štúdia zameraná na sledovanie procesov absorpcie a depozície tymolu v živočíšnom organizme, čo nám pomôže navrhnúť vhodnú dávku s pozitívnym vplyvom na zdravie zvierat s dôrazom na produkciu bezpečných potravín.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2022

Prospešnosť aplikácie bakteriocínov v diéte koní
Benefits of bacteriocins application in horse diet
Program:	Medziakademická dohoda (MAD)
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Lauková Andrea, CSc.
Anotácia:	Cieľom projektu je štúdium prospešného účinku enterocínov u koní na SK a v Poľsku. Naturálne substancie (Slov. partner) budú využité na udržanie dobrej kondície u koní. Študované budú mikrobiota, hematológia, biochémia, fagocytárna aktivita a enzymatický/metabolický profil. V rámci možností sa pokúsime aj o izolovanie antimikrobiálnej substancie z produkčného kmeňa izolované zo vzorky faeces z koňa. V oblasti mikrobioty koní existujú len limitované informácie a vlastne aj ohľadom využitia bakteriocínov pre optimalizáciu fyziol. parametrov. in those animals. Výsledky budú jednak prínosom ku vedomostiam o mikrobiote koní ako aj prínosom ku podpore ich kondície. Najmä využite ngs metód pri mikrobiote umožní popísania mikrobioty od fyla až po spécie.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Nové diagnostické a terapeutické nástroje v liečbe mnoholiekovej rezistencie nádorov
New diagnostic and therapeutic tools against multidrug resistant tumors
Program:	COST
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Messingerová Lucia , PhD.
Doba trvania:	11.9.2018 – 10.9.2022

BACFOOD – Bakteriocíny a ich prospešnosť pri redukcii nežiaducich, biofilm-produkujúcich baktérií z potravín a z prostredia ich výroby
Bacteriocins and their benefits in reduction of spoilage, biofilm-producing bacteria from food products and food industry environment
Program:	Bilaterálne – iné
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Lauková Andrea, CSc.
Anotácia:	Bezpečnosť potravín, ale aj hygiena a bezpečnosť prostredia, v ktorom sú potraviny produkované je prvoradým zámerom nielen producentov potravín, ale aj ich konzumentov.Najviac sú v pozornosti potraviny mliekarenského a mäsového priemyslu. Napriek dodržiavaniu všetkých zásad správnej praxe (ISO, HACCP), môže v reťazci od výrobcu po spotrebiteľa dochádzať ku prípadnej kontaminácii, a tým aj k zníženiu kvality produktov. V súčasnosti sú veľkým problémom biofilm-produkujúce baktérie, ktoré práve tým, že sú v biofilme chránené sa stávajú odolnejšími. Pokiaľ teda ide o nežiaduce biofilm-produkujúce baktérie, môžu spôsobiť nižšiu kvalitu produktu.Predkladaný projekt preto bude riešiť využitie bakteriocínov (antimikrobiálnych substancií produkovaných niektorými baktériami) a ich prospešnosť pri redukcii nežiaducich biofilm-produkujúcich baktérií z potravín a prostredia ich výroby.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2021

ANIMBACHEL – Bakteriocíny, bezpečný spôsob redukovania na antibiotiká rezistentné baktérie pre zachovanie zdravého chovu prasiat
Bacteriocins, a safe way to inhibit antibiotic resistant bacteria from pigs for healthy farming
Program:	Bilaterálne – iné
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Lauková Andrea, CSc.
Anotácia:	V Srbsku je chov prasiat sústredený na tzv. komerčných farmách alebo na rodinných farmách, na dvoroch. Väčšina farmárov sa potýka s finančnými a zdravotnými ťažkosťami v chovoch, a preto siahajú po antibiotikách jednak na profylaktické, ale aj na terapeutické účely, čoho dôsledkom je vysoká rezistencia Git mikrobioty na antibiotiká. Cieľom EU je však redukovanie ATB záťaže v chovoch prasiat a tieto ciele sledujú aj v Srbsku z hľadiska zachovávania verejného zdravia a zdravého farmárčenia, keďže ide o potravinové zvieratá. Preto sa hľadajú nové stratégie na zredukovanie ATB záťaže v chovoch a takouto je aj využitie antimikrobiálnych substancií (bakteriocínov/enterocínov). Preto cieľom predkladaného projektu je eliminácia prevažne koliformných na ATB rezistentných baktérií izolovaných z prasiat použitím enterocínov (od SK) produkovaných probiotickými kmeňmi enterokokov. Originálne výsledky bude možné previesť postupne do praxe na dosiahnutie zdravých ATB nezaťažovaných fariem.
Doba trvania:	15.2.2019 – 31.12.2021

Národné

Nano-Neuro-Plast – Aktivácia VGF/BDNF/TrkB dráhy syntetickou mRNA zapúzdrenou v polyplexových nanočasticiach: účinky na nervovú excitabilitu, neuroplasticitu a správanie zvierat
Activation of the VGF/BDNF/TrkB pathway by synthetic mRNA encapsulated in polyplex nanoparticles: effects on neural excitability, neuroplasticity and animal behavior
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	MMedSc Dremencov Eliyahu, DrSc
Anotácia:	Neuroplasticita je schopnosť centrálneho nervového systému (CNS) sa meniť a prispôsobovať požiadavkám okolia za účelom vytvorenia vhodných adaptívnych odpovedí. Tento zložitý proces sa dosahuje reorganizáciou CNS na štruktúrnej a/alebo funkčnej úrovni. Neuroplasticita je nevyhnutná pre normálnu činnosť CNS. Pri viacerých porucházh CNS, napr. pri depresívnej poruche a pri schozofrénii, nastáva zníženie plasticity mozgu. Neurotrofické rastové faktory ako napr. mozgový neurotrofický rastový faktor (BDNF), VGF a fibroblastový rastový faktor 2 (FGF2) hrajú kľúčovú úlohu v neuroplasticite. Cieľom predloženého projektu je využitie originálneho prístupu, ktorý umožní skúmať účinky neinvazívneho doručenia exogénnej mediátorovej RNA (mRNA) kódujôcej tieto faktory do CNS na neuronálnu excitabilitu, plasticitu a správanie zvierat. Fluorescenčne značená mRNA bude zapúzdrená v polyplexových nanomicelách a aplikovaná intranazálne. Inkorporácia mRNA v štruktúrach CNS bude sledovaná STED mikroskopiou. Budeme skúmať účinky exogénnej mRNA kodujúcej rastové faktory na neuronálnu excitabilitu použitím in vitro a in vivo elektrofyziológie, na neurogenézu použitím použitím značkovačov bunkového delenia a imunohistochemického farbenia a dendrito- a synaptogenéza bude sledovaná elektrónovou mikroskopiou. Zmeny v množstve endogénnej mRNA a expresii proteínov sa preskúmajú použitím real-time PCR a Western blotovaním. Na monitorovanie zmien vo Ca2+ signalizácii sa použije metóda planárnych lipidových membrán. Zmeny v správaní zvierat (kognitívne schopnosti, sociálna interakcia, úzkostné správanie) budú posúdené použitím príslušných behaviorálnych testov. Očakávame, že polyplexné nanomicely, ktoré nadizajnujeme, dopravia zvolenú mRNA kodujúcu neurotrofické faktory do hlbokých mozgových štruktúr a následne vyvolajú pro-neuroplastické, pro-kognitívne a anxiolytické účinky. Tento neinvazívny spôsob doručenia terapeutickej mRNA do mozgu by mohol byť v budúcnosti využitý v moderných stratégiách.
Doba trvania:	1.7.2021 – 30.6.2025

Bakteriocíny a ich využitie na redukciu nežiaducej mikrobioty v chove zvierat
Bacteriocins and their use to reduce spoilage microbiota in animal husbandry
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Pogány Simonová Monika, PhD
Anotácia:	Výskyt meticilínovej rezistencie u stafylokokov je v ostatných rokoch problémom aj v živočíšnej výrobe. Eliminácia meticilín rezistentých (MetR) stafylokokov v zdravých chovoch je problematická práve vzhľadom na ich antibiotickú multirezistenciu. Avšak sľubným riešením sa javí využitie širokého inhibičného spektra enterocínov, bielkovinových substancií produkovaných niektorými kmeňmi z rodu Enterococcus. V predkladanom projekte základného výskumu bude preto na súbore zástupcov nežiaducej mikrobioty (s dôrazom na MetR biofilm-produkujúce stafylokoky z rôznych zvierat) testovaná inhibícia ich rastu enterocínmi charakterizovanými na našom pracovisku. Testovanie bude prebiehať za in vitro ako aj za in vivo podmienok, keď účinok enterocínov na vytypované MetR kmene bude overený v rámci modelového experimentu s použitím experimentálnych (myši) alebo farmových (králiky) zvierat.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Bioaktívne oleje v terapii mikrobiálnych infekcií na modeli aviárnej chorioalantoickej membrány
Bioactive oils in the therapy of microbial infections on avian chorioallantoic membrane
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Máčajová Mariana, PhD.
Anotácia:	V súčasnosti je veľkou výzvou veterinárnej medicíny liečba rôznych mikrobiálnych a kvasinkových infekcií. Pre chovateľov sú niektoré ochorenia ako mastitídy, trichofýcie alebo onychomykózy často likvidačné. V čase rezistencie na antibiotiká prichádzajú na rad iné liečebné postupy. V našom projekte sa pokúsime vytvoriť in vivo model na výskum kvasinkových a bakteriálnych infekcií. Na testovanie účinkov liečiv a liečebných postupov použijeme prepeličiu a morčaciu chorioalantoickú membránu (CAM). Po validácii a optimalizácii modelu budeme povrchovo aplikovať rôzne látky s bioaktívnym účinkom v rôznych koncentráciách a sledovať ich antimikrobiálny účinok a biologický efekt. Budeme sledovať aj aditívny účinok fotodynamickej terapie s použitím kurkumínu a hypericínu. V tkanive CAM budeme sledovať angiogénne zmeny, expresiu vybraných génov, histologické a imunohistochemické zmeny po aplikácii liečiv na organizmus. Získané výsledky budú použiteľné pri liečbe kvasinkových a mikrobiálnych infekcií u zvierat a ľudí.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Biomarkery nutričného a zdravotného statusu hospodárskych zvierat
Nutritional and health biomarkers in farm animals
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Grešáková Ľubomíra, PhD.
Anotácia:	Projekt je zameraný na hľadanie vhodných biomarkerov/ukazovateľov nutričného a zdravotného statusu zvierat, ktoré odrážajú nutričný príjem, nutričný status zvierat a biologické účinky kŕmnych aditív používaných v chove hospodárskych zvierat. Nutričné biomarkery sú biochemické, funkčné alebo klinické indikátory biologického stavu zvierat, ktoré odzrkadľujú krátkodobý alebo dlhodobý príjem živín, nutričný status zvierat závislý od absorpcie prijímaného aditíva a jeho metabolizmus/funkcie v organizme. Keďže zdravotný stav, produktivita a welfare zvierat sú vo veľkej miere závislé od funkčnosti ich tráviaceho traktu, zameriame sa predovšetkým na stanovenie gastrointestinálnych biomarkerov. Vhodnosť vybraných biomarkerov otestujeme v experimentoch s cielenou suplementáciou krmív zvierat. Experimenty budú zamerané na zlepšenie minerálneho statusu a optimalizáciu tráviacich procesov hydiny a oviec, ktoré súčasne povedú k redukcii zaťaženia životného prostredia znižovaním metanogenézy a vylučovania ťažkých kovov.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Diagnostika onkologických ochorení pomocou aptasenzorov: vývoj a validácia
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Poturnayová Alexandra, PhD.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Nový pohľad na izotiokyanáty ako látky zasahujúce do homeostázy neoplasticky transformovaných buniek
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Imrichová Denisa, PhD.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Sledovanie prepojenia molekulárnych dejov vedúcich k rozvoju viacliekovej rezistencie v leukemických bunkách
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Sulová Zdena, DrSc.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Úloha proteín-proteínových interakcií v regulácii srdcového ryanodínového receptora
The role of protein-protein interactions in regulation of the cardiac ryanodine receptor
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Gaburjáková Jana, PhD.
Anotácia:	Ca2+ potrebný na kontrakciu kardiomyocytu sa musí vylúčiť z lumenu sarkoplazmatického retikula (SR) cez srdcový ryanodínový receptor (RYR2), ktorý tak zohráva významnú úlohu v excitačno-kontrakčnej mašinérii. Funkcia RYR2 kanála je regulovaná interakciami s asociovanými proteínmi na jeho objemnej cytoplazmatickej aj menšej luminálnej doméne. V tomto projekte sa zameriame na preskúmanie nových aspektov proteín-proteínových interakcií z luminálnej strany RYR2 kanála, kde zohráva úlohu kalsequestrín (CSQ2) ako možný Ca2+-senzor kanála. Keďže RYR2 kanál disponuje aj vlastným Ca2+ senzorom v jeho prvej luminálnej slučke, objasníme fyziologickú úlohu koexistencie týchto dvoch luminálnych senzorov. Ďalej preskúmame, ako sa štruktúrne zmeny v molekule CSQ2 vyvolané zmenou Ca2+ odzrkadľujú vo funkcii RyR2 kanála vo fyziologických podmienkach a tiež, či regulačnú úlohu CSQ2 môže nahradiť kalretikulín (CRT), ktorého expresia v SR sa pri nedostatku CSQ2 zvyšuje.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Vychytávanie železa a rezistencia na antibiotiká u Enterobacterales potravinových zvierat.
Iron intake and antibiotic resistance in food animal Enterobacterales.
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Bujňáková Dobroslava, PhD
Anotácia:	Základným cieľom projektu bude získanie nových poznatkov o vzťahu rezistencie na antibiotiká, virulencie,vychytávania trojmocného železa a tvorby biofilmu na modelových druhoch baktérií potravinových zvierat t. j.Enterobacterales a Escherichia so zameraním sa na extraintestinálne – ExPEC, avian pathogenic – APEC averotoxigénne – VTEC Escherichia coli, Klebsiella, Enterobacter. Zameriame sa na najdôležitejšie mechanizmyrezistencie: plazmidové ampicilinázy, cefalosporinázy, karbapenemázy, plazmidovú rezistenciu nafluorochinolóny a na rezistenciu na kolistín. U vybraných kmeňov Escherichia coli sa určí klonálna príbuznosť aaj sekvenčný typ (ST). Získané výsledky budú využiteľné v bakteriologickej diagnostike mechanizmov rezistencieinterpretovaným odčítavaním minimálnej inhibičnej koncentrácie antibiotík a vo výučbe študentov.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2024

Kryofertilita – Kryouchovávanie gamét a embryí hovädzieho dobytka pre účely génovej banky
Cryopreservation of cattle gametes and embryos for gene banking
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Antalíková Jana, PhD.
Anotácia:	Významnú úlohu pri riešení problematiky uchovania živočíšnych génových rezerv zohrávajú kryokonzervácia anásledné dlhodobé uchovávanie pohlavných buniek geneticky významných jedincov rôznych plemienhospodárskych zvierat. Metódy zmrazovania oocytov a ovariálnych tkanív musia pritom zabezpečiť ich dobrúkvalitu a životaschopnosť po rozmrazení. V našich predchádzajúcich štúdiách sme otestovali postupkryokonzervácie in vitro maturovaných oocytov hovädzieho dobytka, ktorý sa ukázal byť úspešnejší v porovnaní so zmrazovaním ovariálnych fragmentov obsahujúcich folikuly s nematurovanými oocytmi. Avšak, z dôvodu vysokej variability výsledkov po in vitro oplodnení rozmrazených oocytov táto stratégia vyžaduje ďalšiu optimalizáciu. Projekt bude zameraný na zvýšenie prežívateľnosti oocytov po rozmrazení a minimalizáciu poškodení oocytov vznikajúcich mrazením, a taktiež na podporu bunkového delenia a vývoja preimplantačných embryí získaných invitro zo zmrazených oocytov. V tomto smere okrem optimalizácií režimu kryokonzervácie plánujeme modifikovať kultivačné podmienky použitím špeciálnych prídavkov do kultivačných médií (antioxidanty, rastové faktory, iné).Očakáva sa, že optimalizácia metód zabezpečí vyššiu kryotoleranciu oocytov kráv a in vitro produkovaných embryípre účely uchovávania v génovej banke.
Doba trvania:	1.7.2020 – 30.6.2024

Nová generácia antidepresív – dlhodobé účinky na potomstvo
–
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	prof. RNDr. Lacinová Ľubica, DrSc.
Doba trvania:	1.7.2020 – 30.6.2024

Omnipotence – Obranné mechanizmy mikrobiálnych a živočíšnych buniek pri znižovaní ich citlivosti na rastlinné defenzné zlúčeniny
Defense mechanisms of microbial and animal cells in reducing their sensitivity to plant defensive compounds
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Sulová Zdena, DrSc.
Anotácia:	Živé organizmy si počas evolúcie vyvinuli rôzne stratégie na zabezpečenie lepšieho postavenia v súťaži o životne dôležité zdroje na Zemi. Biosyntéza rôznych biologicky aktívnych látok dávala špecifickým organizmom možnosť byť úspešnejší ako ostatné v spoločnom životnom prostredí. Existuje veľké množstvo prírodných biologicky aktívnych látok, ktoré sa syntetizujú v živých bunkách. Veľký význam medzi týmito látkami majú tie, ktoré sa vyskytujú v rastlinách. Mnoho produktov rastlinného sekundárneho metabolizmu je známych ako účinné farmakologické nástroje. Práve u látok rastlinného pôvodu je možné predpokladať ďalšie široké využitie v rôznych aplikáciách vo veterinárnej a humánnej medicíne, zvyšovaní bezpečností potravín atď. Tieto aplikácie budúpodmienené rozvojom poznatkov v biovedách, ku ktorým má ambíciu prispieť aj predložený projekt. Možnosť synteticky varírovať známe štruktúry látok rastlinného pôvodu dáva prakticky neobmedzené možnosti pre racionálny dizajn nových biologicky aktívnych štruktúr. Preto sme zvolili akronym nášho projektu „omnipotence“. Našim cieľom je teda orientácia na výskum vybraných rastlinných látok a ich semisyntetických analógov ako možných nástrojov modulácie proliferácie a životných prejavov mikrobiálnych a neoplastických buniek. Živé bunky vyvinuli niekoľko obranných stratégií proti toxickému pôsobeniu rôznych látok. Toto sa môže považovať za základnú vlastnosť, ktorá umožňuje bunke prežiť v prirodzenom prostredí. Okrem odozvy špecifickej pre rôzne organizmy sa počas evolúcie vyvinuli všeobecné stratégie prítomné v rôznych typoch živých buniek nevynímajúc cicavčie neoplasticky transformované bunky, eukaryotické a prokaryotické mikrobiálne bunky. Navrhovaný projekt sa bude zaoberať podrobnou analýzou účinkov vybraných rastlinných obranných látok a ich semisyntetickýchderivátov na neoplastické a mikrobiálne bunky.
Doba trvania:	1.7.2020 – 30.6.2024

LEBRE – Viaclieková rezistencia u leukemických buniek – fenotyp spôsobený interferenciou viacerých molekulárnych príčin
Multidrug resistance of leukemia cells – Phenotype caused by interference of multimodal molecular reasons
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Sulová Zdena, DrSc.
Anotácia:	Viaclieková rezistencia neoplastických buniek predstavuje závažný problém pri liečbe nádorových ochorení.Nádorovo transformované bunky si vedia vyvinúť širokú škálu obranných mechanizmov, ktoré im umožnia uniknúť bunkovej smrti vyvolanej účinkom chemoterapeutík. V našom projekte sa budeme venovať výskumu rozvoja a mechanizmov rezistencie v leukemickych bunkách. Najčastejšou príčinou rozvoja rezistencie je zvýšená expresia atransportná aktivita efluxných transportérov z rodiny ABC a to najmä ABCB1 proteínu známeho aj ako Pglykoproteín (P-gp). Naše skúsenosti v predchádzajúcom období ukázali, že pri viacliekovej rezistencii zapríčinenej nadexpresiou P-gp dochádza aj k rôznym zmenám v priebehu významných procesov vedúcich k bunkovej smrti,ako sú: odpoveď na stres endoplazmatického retikula, zmeny v procesoch závislých na koncentrácii vápenatých iónov v intracelulárnom priestore. alebo progresia programovej bunkovej smrti – apoptózy. Sprievodným javom týchto procesov je remodelácia povrchových proteínov plazmatickej membrány, zmeny v ich ubiquitinácii aglykozylácii. Tieto a pravdepodobne aj mnohé iné zmeny vytvárajú zložitý obraz molekulárnych zmienzodpovedných za zníženú odpoveď buniek na farmaká vyvolávajúce smrť leukemických buniek. V predloženom projekte sme si vzali za cieľ prispieť k pochopeniu vzájomnej prepojenosti a súhre rôznych molekulárnych zmien vedúcich k rozvoju viacliekovej rezistencie v leukemických bunkách. Ako model použijeme sublínie buniek, ktorésme získali adaptáciou na látky vyvolávajúce stres endoplazmatického retikula, inhibítory proteazómu,hypometylačné látky a vinkristín.
Doba trvania:	1.7.2020 – 30.6.2024

Interakcie mitochondriálnych genómov
Interactions of mitochondrial genomes
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Bágeľová Poláková Silvia, PhD.
Anotácia:	Evolúciu a pôvod nových druhov je možné experimentálne študovať na kvasinkách, kde nové druhy vznikajú v procese špecializácie z medzidruhových hybridov. Týmto zohrávajú rozhodujúcu úlohu „vyladené“ nukleo-mitochondriálne interakcie. Naším cieľom je použiť celý rad hybridov s rekombinovanou mitochondriálnou DNA (mtDNA) a známou sekvenciou na splnenie cieľov z predchádzajúcich projektov a na objasnenie: (i) nukleo-mitochondriálnych interakcií v medzidruhových hybridoch; ii) charakter supresorových mutácií, (iii) či je na udržanie úplných mitochondriálnych genómov potrebná syntéza mitochondriálnych proteínov, (iv) získanie dôkazov o druhovo špecifickom génovom poradí v mtDNA a o existencii rekombinovaných mtDNA v prírode; (v) skúmať možnosť preskupenia génov v mtDNA (vi) skúmať možnosť komunikácie v kvasinkových mitochondriách prostredníctvom malých proteínov kódovaných génmi pre mitochondriálne ribozomálne RNA.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Kožný mikrobióm psov za fyziologických a patologických podmienok
The skin microbiome in dogs under physiological and pathological conditions
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Strompfová Viola, DrSc.
Anotácia:	Zložitý komplex spoločenstva mikroorganizmov zapojených do významných fyziologických funkcií, ako je biosyntéza a metabolizmus vitamínov a aminokyselín, či modulácia imunitných odpovedí, je prítomný nielen v tráviacom trakte, ale taktiež na povrchu intergumentárneho systému rovnako u ľudí, ako aj u zvierat. Keďže ide o orgán kontinuálne vystavený environmentálnym podmienkam, množstvo faktorov môže prispieť k rozvoju dysbiózy vedúcej ku rôznym dermatologickým problémom veľmi frekventovaným u psov v súčasnosti. Napriek tomu, množstvo poznatkov o zložení, diverzite a funkciách kožnej mikrobioty u psov je zanedbateľné. Preto cieľom tohto projektu bude taxonomická charakterizácia kožnej mikrobioty, uskutočnená kultivačnou metódou a sekvenovaním novej generácie, so zameraním na zdravé jedince, ako aj jedince s rôznymi ochoreniami kože prevažne infekčného a imunitného charakteru. Zároveň budú otestované možnosti optimalizácie/stabilizácie bakteriálneho osídlenia kože pre zachovanie fyziologických funkcií kože.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Kyselina puniková: produkcia a mechanizmy jej účinku v kvasinkách
Punicic acid: production and mechanisms of its action in yeasts
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Holič Roman, PhD.
Anotácia:	Kyselina puniková (18:3Delta9cis,11trans,13cis) je hlavnou zložkou triacylglycerolov v oleji zo semien granátovníka. Vyznačuje sa širokou škálou bioaktívnych účinkov, pričom v súčasnosti sa do popredia dostávajú hlavne jej protirakovinové vlastnosti. Mechanizmus jej účinku nie je známy. Predkladaný projekt sa zaoberá skúmaním jej heterológnej produkcie a lipotoxicity v kvasinkách. Produkcia kyseliny punikovej bude zabezpečená heterológnou expresiou dvoch génov z granátovnika zúčastnených v jej syntéze. V projekte bude študovaná jej distribúcia v bunke, jej vplyv na bunkové delenie a budú hľadané mechanizmy pre jej efektívne uskladnenie vo forme zásobných lipidov. Získané poznatky prispejú k objasneniu protirakovinových účinkov kyseliny punikovej a k identifikácii faktorov dôležitých pre jej nadprodukciu v kvasinkách. Výsledky môžu nájsť uplatnenie aj v biotechnológickej produkcii iných vzácnych mastných kyselín v mikroorganizmoch.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Nova generácia kŕmnych aditív vo výžive zvierat.
New generation of feed additives in animal nutrition.
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Plachá Iveta, PhD
Anotácia:	V poslednom čase zaznamenávame veľký počet vedeckých publikácií venovaných využitiu fytoaditív vo výžive zvierat a to najmä tých, ktoré obsahujú fenolické zložky, ktorým sa vďaka ich chemickej štruktúre pripisujú silné antioxidačné vlastnosti.Väčšina týchto prác je venovaná iba ich vplyvu na produkčné parametre zvierat a iba málo prác je zameraných na mechanizmus účinku týchto zložiek v organizme zvierat ako aj na ich vedecky podložené účinky. Na základe našich vedomostí z odbornej literatúry sme si stanovili cieľ sledovať biologickú aktivitu tymolu, hlavnej bioaktívnej zložky Thymus vulgaris v živočíšnom organizme. Budeme sledovať jeho vplyvna procesy trávenia ako aj jeho depozíciu v jednotlivých orgánoch s cieľom pozitívne ovplyvniť zdravie zvierat. Dosiahnuté výsledky obohatia širokú vedeckú komunitu o vedomosti týkajúce sa mechanizmu účinku bioaktívnych rastlinných zložiek v organizme zvierat.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Plasticita mozgu v spojení s naučenou vokálnou komunikáciou u spevavcov
Brain plasticity associated with learned vocal communication in songbirds
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Niederová-Kubíková Ľubica, PhD.
Anotácia:	Neuroplasticita alebo plasticita mozgu je schopnosť mozgu meniť sa v dôsledku nových skúseností alebo aj poškodenia. Okrem iných faktorov umožňuje neuroplasticitu aj neurogenéza. Poškodenie neurogenézy je späté so zníženými kognitívnymi schopnosťami, zmenami správania, depresiou a rôznymi neurodegeneratívnymiochoreniami. Jedným z faktorov, ktoré by mohli ovplyvňovať neurogenézu, a tým aj učenie, pamäť alebo počet nových neurónov v poškodených oblastiach, sú cirkadiánne hodiny. Ich prítomnosť u rôznych druhov však nie je dobre preskúmaná. Preto naším prvým cieľom je zistiť, či existujú cirkadiánne oscilácie v počte vznikajúcichbuniek u spevavcov. Tie majú s človekom okrem niektorých spoločných znakov neurogenézy ešte podobnú aj schopnosť vokálneho učenia. Po poškodení jednej z oblastí sprostredkujúcich naučený spev sa prejavili zmeny aj v mozočku, ktorý doteraz nebol sledovaný v súvislosti s týmto typom správania. V druhej časti projektu sapreto venujeme štúdiu funkcie mozočka pre naučenú vokalizáciu.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Príjem a metabolizmus externých sterolov počas hypoxického stresu u kvasiniek
Sterol quality control in utilisation of external sterols under hypoxic stress in yeast
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Valachovič Martin, PhD.
Anotácia:	Hypoxický stres je u kvasiniek spojený so zásadnými zmenami v metabolizme membránového sterolu. V predkladanom projekte budeme študovať utilizáciu externých sterolov, predovšetkým živočíšneho cholesterolu a rastlinných sterolov, ako jeden z adaptačných mechanizmov na hypoxické podmienky. Sústredíme sa na skúmanie mechanizmov, ktorými bunka monitoruje kompatibilitu prijatého sterolu s kvasinkovými membránami ako súčasť konceptu, ktorý sme nazvali ‘sterol quality control’. Budeme analyzovať jednotlivé zložky importu: proteíny bunkovej steny, transportéry sterolu v plazmatickej membráne a sterol esterifikujúce enzýmy. S ohľadom na navrhovaný koncept budú analyzované fyzikálne a fyziologicky relevantné vlastnosti membrán, v ktorých bol natívny ergosterol nahradený sterolmi z prostredia. Príjem sterolov od hostiteľa prispieva k rezistencii patogénnych kandíd k antimykotikám, preto má projekt potenciál z hľadiska inovácie existujúcich resp. vývoja nových antifungálnych liekov.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Regulácia ryanodínových receptorov (RYR) z mozgu potkana vo fyziologických a patofyziologických podmienkach
Regulation of ryanodine receptors (RYR) from the rat brain under physiological and pathophysiological conditions
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Gaburjáková Marta, PhD.
Anotácia:	Ryanodínový receptor (RYR) hrá dôležitú úlohu vo Ca2+ signalizácii v neuronálnych bunkách, ktorá sa významnou mierou podieľa na neurotransmisii. V mozgu sa exprimujú všetky tri izoformy RYR kanála, čo značne komplikuje skúmanie ich funkcie a regulácie na úrovni jednotlivých kanálov. Cieľom nášho projektu je rozpoznať jednotlivé izoformy RYR kanála izolovaného z mozgu potkana na základe vytipovaných funkčných parametrov a posúdiť, či existujú tkanivovo špecifické vlastnosti týchto izoforiem. Ďalej budeme sledovať RYR kanály z mozgu potkana v patofyziologických podmienkach, ktoré navodíme odviazaním asociovaného proteínu – FKBP12 – z kanálového komplexu stimuláciou endogénnej fosforylácie. Na RYR2 izoforme (dominantná izoforma v mozgu) otestujeme našu hypotézu o inhibičnom účinku dantrolénu, ktorý sa prejaví iba v určitých podmienkach. Našou snahou je pochopenie molekulárneho mechanizmu terapeutického účinku dantrolénu na niektoré neurodegeneratívne ochorenia, ktoré sú spájané s dysreguláciou RYR kanála.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

Štúdium proteínov tetraspanínovej rodiny v procese reprodukcie hovädzieho dobytka
Study of tetraspanin family proteins in cattle reproduction process
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Jankovičová Jana, PhD.
Anotácia:	Tetraspaníny sú proteíny membrán rôznych typov somatických buniek mnohých živočíšnych druhov podieľajúce sa na nespočetnom množstve funkcií. Na základe popísanej expresie a funkčných experimentoch na myších gamétach je zrejmé, že sa zúčastňujú aj procesu oplodnenia. Naše analýzy potvrdili prítomnosť tetraspanínov CD9 a CD81 aj na býčích spermiách ako aj na oocytoch a embryách hovädzieho dobytka a ošípanej. Nakoľko tieto proteíny pôsobia v rámci komplexu, tzv. tetraspanínovej siete, cieľom predkladaného projektu je štúdium ďalších molekulárnych partnerov, či už z rodiny tetraspanínov alebo iných z hľadiska ich významu v procese reprodukcie hovädzieho dobytka. Získané výsledky by nielen rozšírili poznatky v oblasti fyziológie reprodukcie cicavcov, ale aj mohli prispieť k identifikácii nových markerov využiteľných v praxi, nakoľko reprodukcia hospodárskych zvierat je výhradne riadený proces.
Doba trvania:	1.1.2020 – 31.12.2023

ALTREAT – Alternatívne terapie parazitóz malých prežúvavcov
Alternative parasite control of small ruminant
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Váradyová Zora, PhD
Anotácia:	Choroby spôsobené helmintami hospodárskych zvierat patria popri infekčných ochoreniach medzi najzávažnejšie. Sú zodpovedné za viac ako 55 % všetkých chorôb hospodárskych zvierat v Európe a spôsobujú značné straty produkčných ukazovateľov zvierat. Rozšírenie rezistencie na antihelmintiká u gastro-intestinálnych parazitov hospodárskych zvierat viedlo k zlyhaniu terapie a potrebe vyvinúť nové stratégie a odporúčania na účinnú antiparazitárnu kontrolu. Projekt ponúka alternatívu k súčasne používaným chemoterapeutickým riešeniam parazitóz prežúvavcov a to koncepciu používania herbálnych nutraceutík a stopových prvkov ako kŕmnych aditív a koncepciu obohatenej pastvy. Črevný parazitizmus prispieva k zvyšovaniu emisii skleníkových plynov a preto účinná terapia parazitárnych ochorení prostredníctvom manažmentu pasienkových systémovmôže nielen zlepšiť efektívnosť výroby ale navyše aj znížiť environmentálnu záťaž v chovoch prežúvavcov.
Doba trvania:	1.7.2019 – 30.6.2023

EMBRYOLOSS – Etiológia porúch skorého preimplantačného vývinu
Etiology of early preimplantation development disorders
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Fabian Dušan, DrSc.
Anotácia:	Klesajúca schopnosť embryí vzniknutých po úspešnom oplodnení prežiť prvé dni vývinu spôsobuje ekonomické straty v chovoch zvierat. To, či embryo prežije, závisí na jednej strane od rozsahu indukovaného poškodenia a na druhej od schopnosti embrya napraviť spôsobené poruchy. V rámci projektu budú študované molekulárne mechanizmy, ktorými vybrané exogénne (environmentálna záťaž) a endogénne faktory (narušené materské prostredie) spôsobujú poruchy preimplantačného vývinu. Na myšacom modeli budú analyzované signálne dráhy aktivované špecifickými ligandmi pochádzajúcimi z vonkajšieho prostredia a z materského organizmu. Zistenia osvetlia mechanizmy vzniku a priebehu vývinových porúch, ktoré vyvolávajú insekticídy s embryotoxickým potenciálom a materská obezita. Súbežne bude vyšetrovaná efektivita dvoch základných reparačných mechanizmov v preimplantačných embryách: schopnosť eliminovať poškodené bunky a reparovať poškodenú DNA. Výsledky prinesú nové informácie o fyziologických schopnostiach skorých embryonálnych buniek vysporiadať sa s indukovaným poškodením. Zistenia by mali napomôcť pri riešení problému narastajúceho výskytu post-fertilizačnej neplodnosti.
Doba trvania:	1.7.2019 – 30.6.2023

Kotranskripčné formovanie pre-mRNA štruktúry, model štrukturálnych motívov nevyhnutných pre definíciu exónu
–
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Královičová Jana, PhD.
Doba trvania:	1.7.2019 – 30.6.2023

Charakterizácia biosyntetickej dráhy kardiolipínu kvasinky Schizosaccharomyces pombe ako modelovej eukaryotickej bunky
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Griač Peter, CSc.
Anotácia:	Deliaca sa kvasinka Schizosaccharomyces pombe je významným jednobunkovým modelovým organizmom preštúdium molekulárnej a bunkovej biológie eukaryotov. Biogenéza mitochondriálnych lipidov je u tejto kvasinkyveľmi málo preskúmaná, čo bráni jej využitiu pri modelovaní mitochondriálne podmienených ochorení u ľudí ahľadaní možností terapie. Cieľom projektu je charakterizácia biosyntetickej dráhy jedinečného mitochondriálnehofosfolipidu, kardiolipínu (CL). Analyzujeme viacero enzýmov tejto dráhy: CL syntázu, fosfatidylglycerolfosfát(PGP) syntázu, PGP fosfatázu, ako aj enzýmy zodpovedné za remodelovanie mastných kyselín CL. Zistíme,akým spôsobom je táto dráha regulovaná na transkripčnej a posttranskripčnej úrovni. Porovnáme biogenézu CLu S. pombe a u vyšších eukaryotických organizmov s cieľom posúdiť vhodnosť tohto jednobunkovéhomodelového eukaryotického mikroorganizmu pre štúdium mitochondriálnych procesov.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Kontrola integrity DNA v preimplantačnom embryu
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Baran Vladimír, CSc.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Mechanizmy komunikácie a adaptácie preimplantačného embrya v narušenom prostredí
Mechanisms of communication and adaptation of preimplantation embryo in a disturbed environment
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Čikoš Štefan, DrSc.
Anotácia:	Preimplantačný embryonálny vývin môže byť významne ovplyvnený fyziologickým stavom materského organizmu ako aj environmentálnymi faktormi, pričom poruchy v tomto vývinovom období môžu mať dlhodobé následky, vrátane neúspešnej gravidity, alebo zhoršeného zdravia potomstva, čo vedie k významným ekonomickým stratám v živočíšnej produkcii. V predloženom projekte budú študované mechanizmy komunikácie skorého cicavčieho embrya s okolitým prostredím a reakcie umožňujúce adaptáciu embrya k zmenám v jeho prostredí. Skúmaná bude expresia špecifických typov bunkových receptorov (najmä receptorov viažucich nízkomolekulové ligandy) u preimplantačných embryí a účinok ich aktivácie na skorý embryonálny vývin, najmäna prežívanie buniek a apoptózu. Študované budú aj doposiaľ neobjasnené mechanizmy eliminácie mŕtvychbuniek v preimplantačnom embryu. Výsledky získané na myšacom modeli budú overené u vybranýchhospodárskych zvierat, čo umožní identifikovať konzervované mechanizmy, alebo odhaliť možné medzidruhové rozdiely.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Pilotná štúdia selektívneho pôsobenia novej generácie RNA interferenčných agens na bunkovej úrovni
A pilot study of the selective effects of a new generation of RNA interfering agents at the cellular level
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Poturnayová Alexandra, PhD.
Anotácia:	Predkladaný návrh projektu sa opiera o hĺbkové znalosti súčasného stavu vedeckého i klinického poznaniachronickej myeloídnej leukémie (CML) a terapeutických režimov založených na interferencii s RNA. Projekt sikladie vysoko ambiciózny cieľ: preskúmať selektívny účinok novej platformy RNA interferečných agens nabunkovej úrovni s cieľom vyhodnotiť jej terapeutický potenciál pre pôsobenie bez vedľajších účinkov plynúcich zneželaných interakcií.Z tejto perspektívy sa projekt primárne zameriava na rozsiahle štúdium bunkovej internalizácie, inhibície vznikufúzneho BCR-ABL1 proteínu, selektivitu pôsobenia, a účinku v bunkách rezistentných na súčasne používanéterapeutiká.
Doba trvania:	1.7.2020 – 31.12.2022

KBD – Poškodenia hrebeňa hrudnej kosti – príčiny a dôsledky pre welfare, zdravie a produkciu nosníc
Keel bone damage – causes and consequences for laying hens welfare, health and production
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Bilčík Boris, PhD.
Anotácia:	Poškodenia hrebeňa hrudnej kosti predstavujú v súčasnosti závažný problém ohrozujúci dobré životné podmienky sliepok chovaných na produkciu vajec. Extrémne vysoká frekvencia a závažnosť týchto poškodení negatívne ovplyvňuje nielen welfare, ale aj produkciu a kvalitu vajec. Cieľom predkladaného projektu je preskúmať prevalenciu poškodenia hrebeňa hrudnej kosti v rôznych typoch chovných technológií v podmienkach SR, aplikovať inovatívne spôsoby detekcie fraktúr a deformácií a otestovať možnosti intervencie na úrovni zmien technológie a manažmentu chovu.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Problémové správanie hydiny – vplyv prítomnosti matky a definovanie individuálnych fenotypov náchylných na jeho vývin
Behavioural disturbances in poultry – influence of mother presence and definition of individual phenotypes susceptible to its development
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Pichová Katarína, PhD.
Anotácia:	Chov hydiny a najmä chov nosníc v Európe prechádza výraznými zmenami, ktorých primárnym cieľom jezvyšovanie úrovne welfaru, kvality života zvierat. Napriek snahe sa producenti potýkajú s problémami, medziktoré patrí napríklad nežiaduce správanie ako je ozobávanie peria, agresívne správanie a kanibalizmus, ktorépredstavujú problém tak z hľadiska ekonomického, tak aj z hľadiska welfaru. V súčasnosti narastá tlak na to, abysa tieto problémy riešili spôsobmi ústretovými voči zvieratám samotným a nespôsobovali im dodatočný stres čibolesť. Cieľom projektu je rozšíriť informácie týkajúce sa poškodzujúceho správania u hydiny a prispieť kpochopeniu faktorov ovplyvňujúcich vznik a rozvoj tohto správania, ako je vplyv odchovu s matkou alebo vplyvindividuálnych rozdielov, personality, predispozícií, a v spolupráci s kolegami v zahraničí napomôcť navrhnúťriešenia akceptovateľné aj v poľnohospodárskej praxi.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Štúdium a využitie bakteriocínov v prevencii moru včielieho plodu
Study and use of the bacteriocins in prevention of American foulbrood
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Kopčáková Anna, PhD.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

Výskum zmien vo fenotype leukemických buniek po indukcii membránového transportéra ABCB1.
Study of alteration in leukemia cells phenotype after induction of ABCB1 membrane transporter
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	prof. Ing. Breier Albert, DrSc.
Anotácia:	Rozvoj poznatkov biologických vied priniesol možnosti presnej analýzy genómu, proteómu, glykómu a lipidómu.Toto umožňuje charakterizáciu geno- a fenotypových zmien u pacientov a ich dopad na voľbu optimálnehoterapeutického postupu, ako aj na celkovú prognózu liečby. Presná typizácia priniesla viaceré úspechy prinávrhu liečebných postupov aj u pacientov s krvnými maliganciami. Pri chemoterapii leukémie sa všakstretávame s rozvojom viacliekovej rezistencie, ktorá je závažný negatívny prognostický faktor. Najčastejšoumolekulárnou príčinou viacliekovej rezistencie je zvýšená expresia membránových transportérov z rodiny ABC(najmä P-glykoproteínu, P-gp). P-gp v leukemických bunkách zabezpečuje rozvoj rezistencie voči jehosubstrátom. Expresia P-gp je v leukemických bunkách sprevádzaná zmenami v profile bunkových proteínov a ichglykozylácie, s čím sú spojené zmenené fenotypové prejavy leukemických buniek. Predložený projekt budezameraný na štúdium mechanizmov spomínaných zmien.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2022

FUPKOPROSP – Funkčné potraviny na báze kozieho mlieka a ich prospešnosť pre zdravie
Functional food based on goats milk and its benefit on health
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	MVDr. Lauková Andrea, CSc.
Anotácia:	Pod pojmom funkčné potraviny rozumieme bežné/tradičné potraviny, ktoré sú obohatené takou zložkou, ktoráich robí funkčnými v zmysle podpory imunity, dodania minoritných látok do tela s cieľom prospešne ovplyvniť zdravie. Z hľadiska mliekarenskej výroby či poľnohospodárstva sa v súčasnosti preferuje kozie mlieko a produkty z neho a v rámci funkčných potravín sa pre začlenenie veľmi dobre uplatňujú probiotické baktérie teda také,ktoré po kolonizácii organizmu dokážu vytvoriť ideálne prostredie svojimi metabolitmi alebo naviazaním sa nareceptory ovplyvňujúce či súvisiace s imunitným systémom.Takéto baktérie môžu dosiahnuť hostiteľskýorganizmus/konzumenta dvoma spôsobmi: buď priamou aplikáciou (per os) alebo práve cez potraviny. Vpredkladanom projekte sa zameriame na izoláciu, identifikáciu, všeobecnú a technologickú charakterizáciu autochtónnych kyselinu mliečnu produkujúcich baktérií z kozieho mlieka a syrov od rôznych slovenských spracovateľov a vyselektujeme vhodný kmeň pre aplikačné použitie vo výrobkoch z kozieho mlieka v poloprevádzakových podmienkach a u odberateľa aplikačného výstupu; otestujeme jeho aplikačnú formu a účinky ako funkčnej potraviny u dobrovoľníkov (cez syry prípadne iné výrobky z kozieho mlieka). Ako aplikačný výstup tak získame autochtónnu kultúru použiteľnú pre technologické spracovanie kozieho mlieka resp.výrobkov,ktoré v súvislosti s ich prospešným účinkom na konzumenta budeme môcť zaradiť medzi funkčné potraviny.
Doba trvania:	1.8.2018 – 31.7.2022

iPoW – Behaviorálne a fyziologické indikátory welfaru hydiny
Behavioural and physiological indicators of poultry welfare
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Košťál Ľubor, CSc.
Anotácia:	Faktory, ktoré ovplyvňujú dobré životné podmienky (welfare) zvierat zahrňujú fyzické prostredie a zdroje, ktoré má zviera k dispozícii (na zdrojoch založené ukazovatele) a postupy manažmentu na farme (ukazovatelezaložené na manažmente). V závislosti na jeho charakteristikách (plemeno, pohlavie, vek atď.) zviera reaguje na tieto vstupy a jeho odpovede sú hodnotené pomocou ukazovateľov welfaru založených na zvieratách. Projekt Welfare Quality®, ale aj EFSA vo svojich vedeckých stanoviskách, priniesli nástroje na hodnotenie welfaru na základe ukazovateľov založených na zvieratách u rôznych hospodárskych zvierat, vrátane hydiny. Napriek tomu je naďalej potrebné vyvíjať špecifickejšie ukazovatele a nové metódy na meranie uznávaných ukazovateľov. Cieľom projektu je napomôcť k riešeniu problému rizika poškodzujúceho správania nosníc v skupinovomustajnení bez potreby bolestivého skracovania zobáka, prispieť k poznaniu vzťahu kognície a emócií u hydiny, posúdiť možnosť epigenetického ovplyvnenia welfaru maternálnymi androgénmi s použitím modelu línií prepelice japonskej selektovaných na obsah testosterónu vo vajci, resp. možnosť epigenetického ovplyvneniawelfaru vplyvom kvality osvetlenia v prenatálnom a ranom postnatálnom období, analyzovať možnosť využitiaimunologických indikátorov na hodnotenie welfaru a validovať laboratórne postupy analyzujúce metabolity kortikosterónu a androgénov v truse hydiny, ktoré by mohli slúžiť na neinvazívne hodnotenie welfaru.
Doba trvania:	1.8.2018 – 30.6.2022

BIOZINC – Biovyužiteľnosť zinku u hospodárskych zvierat – možnosti a riešenia
Bioavailability of zinc in animals – the possibilities and solutions
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Čobanová Klaudia, PhD.
Anotácia:	Ciele predkladaného projektu sú zamerané na získanie nových poznatkov o biovyužiteľnosti zinku z jeho rôznych, prevažne organických zdrojov, používaných ako kŕmne aditíva vo výžive zvierat. Budeme študovať dopad aplikácie rastlinných aditív s obsahom sekundárnych rastlinných metabolitov, vlákniny a fytázy v diéte na absorpciu, retenciu a tkanivovú depozíciu zinku u prežúvavcov a monogastrických zvierat. Zároveň budeme sledovať vplyv organického zinku a rastlinných nutraceutík na fyziologické procesy gastro-intestinálneho traktu v in vitro a in vivo podmienkach a na antioxidačný status hospodárskych zvierat. Naším zámerom bude zvýšiť možnosti efektívneho používania minerálnych aditív vo výžive zvierat a prispieť tak k zníženiu negatívneho dopadu živočíšnej výroby na životné prostredie.
Doba trvania:	1.8.2018 – 30.6.2022

Dbl2 – Proteín Dbl2 ako nový regulátor stability a dynamiky genómu v kvasinkách Schizosaccharomyces pombe
Dbl2 protein as a novel regulator of genome stability and dynamics in fission yeast
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Bágeľová Poláková Silvia, PhD.
Anotácia:	Pohlavné rozmnožovanie je predovšetkým závislé od špecializovaného bunkového delenia nazývaného meióza, pri ktorom vznikajú pohlavné bunky s polovičnou sadou chromozómov. Na identifikáciu nových proteínov podieľajúcich sa na regulácii meiotického bunkového delenia sme uskutočnili analýzu delečnej knižnice kvasinky Schizosaccharomyces pombe. Zistili sme, že delécia dbl2 génu vedie k missegregáciam chromozómov. Pozorovanie dbl2Δ živých buniek pomocou fluorescenčného mikroskopu ukázalo, že u dbl2Δ mutanta chromozómy často nesprávne segregovali počas meiotického ako aj mitotického bunkového delenia. Ďalšie cytologické a biochemické analýzy odhalili, že k poruchám v segregácii chromozómov dochádza v dôsledku neodstránených medziproduktov opravy dvojvláknových zlomov DNA. Naše analýzy ukázali, že Dbl2 proteín je potrebný pre vytvorenie ohnísk Fbh1 DNA helikázy v miestach týchto zlomov. Naše predbežné výsledky tiež naznačujú, že Dbl2 proteín je nielen faktorom udržiavania stability genómu, ale je aj súčasťou molekulárneho mechanizmu podieľajúceho sa na znižovaní množstva proteín-kódujúcich a nekódujúcich RNA. Cieľom predkladaného projektu je detailná analýza molekulárnych mechanizmov, ktorými Dbl2 reguluje stabilitu genómu a génovú expresiu. Na objasnenie funkcie novoidentifikovaného Dbl2 proteínu plánujeme použiť klasické metódy genetiky a biochémie v kombinácii s modernou mikroskopiou a RNA a ChIP sekvenovaním novej generácie. V našom výskume ďalej plánuje rekonštituovať študované bunkové procesy in vitro. Predpokladáme, že naše výsledky budú mať v budúcnosti široké uplatnenie ako v oblasti regulácie pohlavného rozmnožovania tak aj pri liečbe nádorových ochorení.
Doba trvania:	1.7.2019 – 30.6.2022

SWIREG – Regulácia komplexu Swi5-Sfr1 pomocou fosforylácie.
Regulation of the Swi5-Sfr1 complex by protein phosphorylation.
Program:	APVV
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Bágeľová Poláková Silvia, PhD.
Anotácia:	Homologická rekombinácia je dôležitá nielen pre opravu poškodenej DNA vo vegetatívnych bunkách, ale je nevyhnutná aj pre správnu segregáciu chromozómov počas meiózy – špecializovaného delenia buniek, ktorého výsledkom sú haploidné gaméty ako sú vajíčka a spermatické bunky cicavcov a spóry u kvasiniek. Heterodimér Swi5-Sfr1 stimuluje Rad51-sprostredkovanú výmenu DNA vláken, kľúčový krok v homologickej rekombinácii. V skríningu mutantov s poruchou v segregácii chromozómov počas meiózy sme u kvasinky Schizosaccharomyces pombe identifikovali delečných mutantov swi5 a sfr1. Naša počiatočná charakterizácia potvrdila nové miesta fosforylácie na oboch proteínoch Swi5 a Sfr1. V tomto projekte chceme zistiť, ako fosforylácia reguluje úlohu Swi5 a Sfr1 vo vegetatívnych aj meiotických bunkách S. pombe. Toto nám pomôže porozumieť procesom homologickej rekombinácie a redukcie počtu chromozómov v meióze. Oba proteíny Swi5 a Sfr1 sú evolučne konzervované, čo zvyšuje pravdepodobnosť, že naše výsledky budú využiteľné aj pri štúdiách na rôznych organizmoch vrátane cicavcov.
Doba trvania:	1.7.2018 – 30.6.2022

Analýza alelovo-špecifickej regulácie expresie CD33
Analyses of allele-specific regulation of CD33 expression
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Královičová Jana, PhD.
Doba trvania:	1.1.2018 – 31.12.2021

–
External sterol utilization protects yeast membranes under hypoxic stress
Program:	DoktoGranty
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Petrisková Lívia
Anotácia:	Hypoxický stres je u kvasiniek spojený so zásadnými zmenami v metabolizme membránového sterolu. V predkladanom projekte budeme študovať utilizáciu externých sterolov, predovšetkým živočíšneho cholesterolu a rastlinných sterolov, ako jeden z adaptačných mechanizmov na hypoxické podmienky. Sústredíme sa na skúmanie mechanizmov, ktorými bunka monitoruje kompatibilitu prijatého sterolu s kvasinkovými membránami ako súčasť konceptu, ktorý sme nazvali ‘sterol quality control’. Budeme analyzovať najvýznamnejšie etapy importu, predovšetkým transport cez plazmatickú membránu prostredníctvom importérov sterolu a esterifikáciu sterolu spojenú s relokalizáciou sterolu do lipidových partikúl. S ohľadom na navrhovaný koncept budú analyzované fyzikálne a fyziologicky relevantné vlastnosti membrán, v ktorých bol natívny ergosterol nahradený sterolmi z prostredia. Využívanie sterolov hostiteľa prispieva k rezistencii patogénnych kvasiniek k antimykotikám, preto má projekt potenciál z hľadiska inovácie existujúcich resp. vývoja nových antifungálnych liekov.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2021

Fotodynamická terapia nádorových buniek karcinómu krčka maternice na modeli chorioalantoickej membrány morčacieho embrya
–
Program:	DoktoGranty
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Kundeková Barbora
Anotácia:	Fotodynamická terapia (PDT) má veľlký potenciál ako alternatívna liečba nádorových ochorení. Využíva sa pri nej fotosenzibilizátor, látka, ktorá je vychytávaná primárne nádorovými bunkami a po osvetlení správnou vlnovou dĺžkou vedie k bunkovej smrti. PDT pritom môže byť nasmerovaná priamo na bunky nádoru, alebo na okolité cievy vyživujúce nádor. Perspektívnym in vivo modelom pre štúdium nádorových ochorení je chorioalantoická membrána (CAM) embrya morky domácej (Meleagris gallopavo). CAM svojou hustou vaskulárnou sieťou vyživuje rastúce tumory a poskytuje im, na rozdiel od in vitro bunkových kultúr, autentické prostredie živého organizmu, priamo reagujúce na účinky liečby. Zároveň výber CAM morčacieho embrya, oproti bežnejšie využívaným kuracím embryám, umožňuje pre svoj dlhší embryonálny vývin časovo náročnejšie experimenty a dlhšiu kultiváciu tumoru a uľahčuje intravenózne podávanie látok. Tiež sa ukazuje byť vhodnejším modelom pre prežívanie buniek a tvorbu metastáz. Našim cieľom je využiť výhody morčacej CAM na vytvorenie in vivo modelu karcinómu krčka maternice s využitím bunkovej línie HeLa a na vzniknuté nádory aplikovať PDT pomocou fotosenzibilizátoru hypericínu. Budeme vyhodnocovať úspešnosť PDT po povrchovom, aj intravenóznom podaní liečiva a sledovať vplyv PDT na okolité zdravé tkanivo CAM a zmeny vo vaskulárnej sieti.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2021

Funkčná analýza nových proteínov potrebných pre meiotickú rekombináciu
Functional analysis of new proteins required for meiotic recombination.
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Bágeľová Poláková Silvia, PhD.
Anotácia:	Pohlavné rozmnožovanie je závislé predovšetkým od špecializovaného bunkového delenia nazývaného meióza, pri ktorom vznikajú pohlavné bunky s polovičnou sadou chromozómov. Z medicínskeho hľadiska je absolútne nevyhnutné, aby toto rozdelenie chromozómov prebehlo bez chyby, pretože v dôsledku poruchy meiózy dochádza ku genetickým defektom, ako je napríklad Downov syndróm. Cieľom tohto projektu je objasniť molekulárnu funkciu nových proteínov potrebných pre správnu meiotickú segregáciu chromozómov v kvasinkách Schizosaccharomyces pombe. V našom predchádzajúcom projekte sme z delečnej knižnice mutantov identifikovali 25 nových proteínov, ktorých funkcia v procese meiózy nebola doposiaľ objasnená. Funkčná analýza troch takýchto proteínov, Dbl2, Mal3 a Mto1, bola nedávno publikovaná našou skupinou (Polakova et al., 2016; 2014). Výsledky tohto projektu jasne dokazujú, že mnohé kľúčové proteíny s regulačnou funkciou v meióze neboli doposiaľ identifikované a preto prinášajú možnosť ďalšieho vedeckého výskumu.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2021

Charakterizácia nového kvasinkového modelu pre štúdium Barthovho syndrómu.
Characterization of new yeast model of Barth syndrome.
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Balážová Mária, PhD.
Anotácia:	Barthov syndróm (BTHS) je závažné dedičné mitochondriálne ochorenie charakterizované zníženým množstvomkardiolipínu a akumuláciou jeho prekurzora monolyzokardiolipínu, ktorých zmenu spôsobuje strata transacylázytaffazín. Molekulárna podstata vzniku tohto ochorenia je však stále nejasná. Cieľom tohto projektu jecharakterizácia nového kvasinkového modelu BTHS (pgc1taz1 mutant) a jeho využitie pre štúdium úlohyrozdielnych lipidov, fosfolipidov a sfingolipidov, v mitochondriálnej morfológii a funkcii, či v produkcii voľnýchkyslíkových radikálov. Využitie kvasinkového systému zvýši možnosti k identifikácii molekulárnych mechanizmov,ako zmena v zložení membránových lipidov vedie k defektom mitochondriálnej funkcie a morfológie nie len uBTHS, ale taktiež u iných mitochondriálnych ochorení.
Doba trvania:	1.1.2018 – 31.12.2021

Napäťovo závislé vápnikové kanály v nocicepcii
Voltage dependent calcium channels in nociception.
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	prof. RNDr. Lacinová Ľubica, DrSc.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2021

Potenciálne využitie stabilizátorov nálady na obnovenie mitochondriálnej funkcie
–
Program:	DoktoGranty
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Káňovičová Paulína
Anotácia:	Barthov syndróm (BTHS) je závažné genetické ochorenie, spôsobené poruchou biosyntézy špeciálneho mitochondriálneho fosfolipidu kardiolipínu. Pokles kardiolipínu vedie k narušeniu mnohých mitochondriálnych funkcií, čoho dôsledkom je nedostatočná tvorba energie v podobe molekúl ATP. Poškodenie metabolizmu mitochondrií je spájané s mnohými patológiami vrátane psychiatrických ochorení. Tie sú často liečené valproátom (VPA). V našom doterajšom výskume sme zistili pozitívny vplyv VPA na poškodenú mitochondriálnu respiráciu a aktivity komplexov dýchacieho reťazca v kvasinkovom modeli BTHS. Štúdium sme následne rozšírili na iný modelový organizmus BTHS, TAZ-KO mutant vytvorený CRISPR/Cas9 systémom v ľudskej haploidnej nádorovej línii HAP1. Rovnako ako u kvasiniek sme i v tomto modeli pozorovali pozitívny vplyv VPA na aktivitu proteínových komplexov dýchacieho reťazca. Podávanie VPA má však pleiotropný charakter. V navrhovanom projekte plánujeme overiť potenciálny terapeutický účinok VPA na harmonizáciu mitochondriálnej funkcie v bunkách ľudského modelu BTHS.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2021

PuriTAAR – Štúdium mechanizmov účinku nových antidepresív: pyridoindolové deriváty a ligandy „trace amine-associated receptor one“ (TAAR1)
Investigation of the mechanism of action of novel putative antidepressant drugs: pyridoindole derivatives and trace amine-associated receptor-1 (TAAR1) ligands
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	MMedSc Dremencov Eliyahu, DrSc
Anotácia:	Cieľom projektu bude zistiť mechanizmy účinku nových pyridoindolových zlúčenín s potenciálnym antidepresívnym účinkom a ligandov „trace amine-associated receptor one“ (TAAR1). Testované látky budú podávané laboratórnym potkanom a bude sa sledovať správanie podobné depresii a úzkosti. Ďalej sa bude hodnotiť excitabilita neurónov sekretujúcich glutamát, serotonín, noradrenalín a dopamín v in vivo podmienkach ako aj s použitím primárnych neuronálnych kultúr. Projekt sa bude realizovať v spolupráci s biofarmaceutickým priemyslom.
Doba trvania:	1.1.2018 – 31.12.2021

–
The fission yeast Dbl2 protein and its role in chromatin architecture
Program:	DoktoGranty
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Piteľová Alexandra
Anotácia:	Analýza transkriptómu dbl2 mutanta u kvasinky Schizosaccharomyces pombe ukázala, že delécia génu dbl2, kódujúceho proteín zapojený v DNA oprave a homologickej rekombinácii, vedie k zmene expresie viac ako 500 lokusov. V porovnaní s regiónmi bez zmenenej expresie sú tieto deregulované oblasti lokalizované štatisticky bližšie k dlhým terminálnym a tandemovým repetíciám, vrátane antisense transkriptov, retrotranspozónov, meiotických génov a génov nachádzajúcich sa v subtelomerických oblastiach. Následné porovnanie expresných profilov ukázalo, že Dbl2 reprimuje rovnaký typ génov ako HIRA komplex (histón šaperónový komplex) a Clr6 (H3-K9 špecifická histón deacetyláza). Aj napriek tomu, že sa podieľajú na regulácii expresie rovnakých cieľových oblastí v genóme, súčasná delécia Dbl2 a HIRA (hip1, slm9) alebo Clr6 nevedie ku kumulatívnemu navýšeniu expresie, čo naznačuje ich zapojenie v rovnakej dráhe ovplyvňujúcej génovú expresiu. Tento projekt by mohol objasniť mechanizmus zatiaľ nepopísaného prepojenia celej dráhy homologickej rekombinácie s histón šaperónovým komplexom HIRA.
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2021

Vplyv látok vyvolávajúcich stres endoplazmatického retikula na regulačné mechanizmy bunkového cyklu buniek s viacliekovou rezistenciou
Effect of endoplasmic reticulum-stress inducing substances on cell cycle regulatory mechanisms in cell lines with MDR phenotype
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Šereš Mário, PhD.
Anotácia:	V myších leukemických bunkách L1210 sme po navodení expresie P-glykoproteínu (P-gp) pozorovali zvýšenúrezistenciu nielen na substráty Pgp, ale aj na cisplatinu (cytostatikum, ktoré nie je substrátom P-gp) a na látkyvyvolávajúce stres endoplazmatického retikula ako sú tapsigargín a tunikamycín. Pozorovali sme výraznérozdiely v interakcii s lektínmi medzi P-gp pozitívnymi a P-gp negatívnymi bunkami L1210. Prítomnosť P-gp vtýchto bunkách vyvoláva rozsiahle zmeny bunkových regulačných procesov vrátane fosforylácie a glykozylácieproteínov, ako aj reguláciu iniciácie a progresie apoptózy a nakoniec rýchlosti bunkového delenia. Narušenieregulácie bunkového cyklu v nerakovinových bunkách spôsobuje vznik tumorov, zvýšenie množstva cyklínovako aj mutácie na proteíne p53 nájdené u 50% rôznych typov rakovinových ochorení. Získanie novýchpoznatkov o regulácii bunkového cyklu spätej s expresiou P-gp môže prispieť k lepšiemu pochopeniumechanizmov uplatňujúcich sa pri rozvoji viacliekovej rezistencie.
Doba trvania:	1.1.2019 – 31.12.2021

Vplyv polyfenolov na funkcie signálnych proteínov zahrnutých v N-glykozylácii proteínov v endoplazmatickom retikule leukemických buniek v závislosti od expresie P-glykoproteínu
The effect of polyphenols on the functions of signal proteins involved in proteins N-glycosylation in the endoplasmic reticulum of leukemia cells, depending on the expression of P-glycoprotein
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	RNDr. Boháčová Viera, CSc.
Anotácia:	Schopnosť buniek odolávať účinku látok s rôznou štruktúrou a mechanizmom účinku sa nazýva viacliekováalebo multidrug rezistencia – MDR. Cieľom mnohých štúdií je hľadanie mechanizmov vzniku MDR a spôsobovjej potláčania. P-glykoproteín (P-gp, člen rodiny ABC transportérov) je asi najčastejšie popisovanou príčinourozvoja MDR v neoplastických bunkách. Transportná funkcia P-gp môže byť ovplyvnená rôznymi skupinamilátok napr. polyfenolmi (quercetín). Významným zdrojom rôznych prírodných polyfenolov sú listy zeleného čaju(camellia sinensis). Extrakt čaju má liečivé účinky, obsahuje rôzne druhy katechínov, ktoré sa považujú zabioaktívne látky. Táto štúdia je zameraná na vplyv bioaktívnych látok na expresiu šaperónov, pomocnýchproteínov potrebných pre maturáciu, stabilitu a udržiavanie aktívnych proteínov v bunkách. Ďalej sa zameriamena bunkový cyklus a expresiu transkripčných proteínov p53 a p21, dôležitých pre vstup buniek do bunkovéhocyklu a následného delenia.
Doba trvania:	1.1.2018 – 31.12.2021

Vplyv vičenca vikolistého (Onobrychis viciifolia) na bachorovú fermentáciu, protozoálnu populáciu a hematologický profil u jahniat s hemonchózou
–
Program:	DoktoGranty
Zodpovedný riešiteľ:	Ing. Petrič Daniel
Doba trvania:	1.1.2021 – 31.12.2021

Vzťah mikroarchitektúry mitochondriálnej siete a jej funkčného spriahnutia v kardiomyocytoch
–
Program:	VEGA
Zodpovedný riešiteľ:	Mgr. Macková Katarína, PhD.
Doba trvania:	1.1.2018 – 31.12.2021