Výskumné záujmy
Hlavné ciele Laboratória mikrobiálnej genetiky sú zamerané na výskum gastrointestinálnej a kožnej mikroflóry spoločenských, voľne žijúcich a hospodárskych zvierat, vrátane včiel. Primárnou oblasťou záujmu je monitorovanie fenotypovej a genotypovej rezistencie gastrointestinálnych Gama Proteobaktérií (Escherichia coli, Klebsiella sp., Pseudomonas aeruginosa) so zameraním sa na najdôležitejšie mechanizmy rezistencie, ako sú plazmidové ampicilinázy, cefalosporinázy, karbapenemázy, plazmidovú rezistenciu na fluorochinolóny a rezistenciu na kolistín a baktérie Staphylococcus sp. izolované z mliečnej žľazy a kože, s cieľom zistiť nebezpečné typy rezistencie, ako sú MRSA, MRCoNS, VRSA alebo MLSB. Okrem toho naše laboratórium skúma progresívne a nové ekologické stratégie boja proti infekciám zvierat spôsobeným multi-drogovo rezistentnými baktériami produkujúcimi biofilm, ako sú rôzne prírodné látky (probiotiká – bakteriocíny; bioaktívne zlúčeniny rastlinného pôvodu; organické kyseliny; kmeňové bunky – antimikrobiálne peptidy; kovové prvky – nanočastice; bakteriofágy atď.) Výskum zameraný na testovanie antibiotických a antibiofilmových účinkov vybraných prírodných zložiek predstavuje základ pre vývoj nových terapeutických prostriedkov, ktoré sú prínosom nielen pre veterinárnu prax (pri manažmente rekurentných infekcií), ale zároveň rešpektujú stratégiu Európskej únie „Z farmy na vidličku“, predstavujúcu zásadný nástroj v boji proti antibiotickej rezistencii.
Prístrojové vybavenie
- Kapilárový mikroelektroforetický systém Agilent 2100 pre automatickú elektroforetickú analýzu DNA, RNA a proteínov na čipe, s možnosťou jednoduchej flow-cytometrickej analýzy.
- MALDI TOF – Biotyper firmy Bruker na bakteriálnu diagnostiku a stanovovanie biodiverzity baktérií a kvasiniek na základe bielkovinových spektier.
- DCode Universal Mutation Detection System firmy BioRad s rozšírením pre DGGE analýzy.
- CHEF-DR III Systém pre pulznú elektroforézu.
- ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer pre sekvenčnú analýzu s rozšírením pre fragmentačnú analýzu.
Zoznam pracovníkov
Zuzana Alexiová
RNDr. Dobroslava Bujňáková, PhD. – vedúca laboratória
MVDr. Tímea Galambošiová
RNDr. Anna Guľašová
Ing. Ľudmila Hamarová, PhD.
RNDr. Silvia Ivorová
MVDr. Lívia Karahutová, PhD.
RNDr. Anna Kopčáková, PhD.
Doc. RNDr. Peter Pristaš, CSc.
MVDr. Viola Strompfová, DrSc.
MVDr. Lucia Štempelová, PhD.